Lave as cebolinhas em água fria e seque. Apare as pontas da raiz. Separe os caules e as folhas e corte-os em 3 pedaços cada. Corte as folhas em pedaços aproximadamente do mesmo tamanho do penne. Coloque os caules e as folhas em uma tigela, cubra com uma toalha de papel úmida e leve à geladeira.
Leve o caldo de frango para ferver em uma panela média. Tempere levemente com sal e mantenha aquecido.
Aqueça ½ xícara de azeite em uma panela grande em fogo médio-alto. Adicione a chalota e sue até ficar macia e translúcida, cerca de 3 minutos. Adicione o penne e as torradas por 1 minuto, mexendo sempre com uma espátula de madeira ou colher.
Adicione o vinho branco e leve para ferver, mexendo sempre. Cozinhe até que o vinho tenha evaporado quase completamente. Adicione 1 ½ xícara de caldo de frango e leve para ferver. Cozinhe, mexendo ocasionalmente, por 5 minutos e, em seguida, adicione o molho. Leve ao fogo brando, mexendo delicadamente de vez em quando. Lentamente, adicione o caldo de galinha restante, ½ xícara por gravata, cozinhando e mexendo de vez em quando, como se fosse um risoto, até que o penne esteja al dente e ainda haja um pouco de líquido de cozimento na panela, cerca de 10 minutos no total.
Enquanto isso, misture ½ xícara de azeite de oliva restante e o alho em fatias finas em uma frigideira grande e leve ao fogo médio-alto. Quando o alho começar a chiar acrescente os tomates, tempere com sal e pimenta e refogue por 3 minutos. Adicione as cebolinhas e cozinhe por mais 1 minuto.
Adicione os tomates e as cebolinhas ao penne. Ajuste o fogo para médio-alto e cozinhe por 2 minutos para permitir que a massa absorva um pouco do molho. Tempere a gosto com sal e pimenta, acrescente o manjericão e sirva imediatamente.